1971年4月改稱縣衛生學校，隸屬縣衛生戰線革命委員會、縣衛生局，1977年改屬縣人民醫院，1980年又隸屬縣衛生局。1986年2月，經省高教局批準，升格為縣衛生職工中等專業學校；1989年3月，經縣委、縣政府批準，升格為局級單位，隸屬縣衛生局；1992年6月至2002年12月改稱縣（市）衛生成人中等專業學校，仍隸屬縣（市）衛生局。2002年8月11日，南海市衛生成人中等專業學校搬往新址：桂城雷崗公園內（原少工委培訓基地），20日正式使用。2003年5月南海區政府批復“南海市衛生成人中等專業學校”更名為“佛山市南海區衛生職業技術學校”（南府函〔2003〕69號）。2003年11月省教育廳網上公布了南海衛校為首批辦學評估合格學校(粵教職【2003】103號)。2009年9月學校搬遷至西樵鎮上金甌（原樵崗中學舊址）擴大規模辦學至今。2000年9月起首次與佛山職工醫學院聯辦護理大專班，2002年秋季至今，先后與江西中醫學院、中南大學湘雅醫學院、贛南醫學院、華中科技大學網絡學院、廣州醫學院、廣州中醫藥大學聯合辦學開展成人在職學歷教育。

2011年劃歸南海區教育局管轄，屬公辦、區直職業學校。也是佛山市唯一一所衛生類中等職業學校。主要承擔護理、藥學和康復技術類人才培養。在校生約3000人。

2014年加掛“南海區第二職業技術學校”牌，實行兩個牌子一套人馬辦學模式。計劃2015年增設經貿商科類專業并開始招生。